Os dados divulgados pelo Ministério do Desenvolvimento, Indústria e Comércio Exterior (MDIC) referentes à balança comercial de Rio Verde em 2006 confirmaram a tendência de queda nas exportações de soja, seus derivados, e de milho exportados pelo Município, além do aumento das exportações de carne bovina, comparativamente a 2005.
 
Em 2005, quando Rio Verde foi o segundo Município que mais exportou em Goiás, o carro-chefe das exportações foi a soja. O grão, o bagaço e outros resíduos da soja extraídos do óleo e o próprio óleo de soja, em bruto, responderam por 82,834% do que Rio Verde exportou: US$ FOB 151.223.704,00. Em 2006, as exportações desses mesmos sub-produtos totalizaram US$ FOB: 22.658.507,00 e corresponderam a 22,66% do que Rio Verde exportou.
 
Segundo empresas do setor ouvidas pelo Escritório Municipal de Exportação, a quebra de safra, de tecnologia e a melhor remuneração dos produtos e sub-produtos no mercado interno são os principais fatores responsáveis pela significativa queda nas exportações da soja.
 
A balança comercial do Município caiu 45,54% de 2005 para 2006 e só não foi mais prejudicada porque o espaço da soja foi, em parte, compensado pelo aumento das exportações de carne, principalmente bovinas, e de outros grãos como o algodão, o sorgo,  e sementes de girassol que aumentaram, no período, respectivamente: 20,61%, 234,64% e 312,27%. Fora a soja, as exportações de milho também caíram: 84,32%.
 
Rio Verde ficou em 6° lugar no ranking goiano de exportações
 
O aumento das exportações de carne bovina ajudou a melhorar os índices de exportação de Rio Verde. De 2005 para 2006 houve um aumento médio de 170% apenas nas exportações de carnes bovinas congeladas e frescas ou refrigeradas. Segundo representante do Frigorífico Margem – principal exportador de carne bovina no Município, as principais causas para esse aumento das exportações bovinas foram: aumento do volume exportado, principalmente pela retomada de antigos mercados como a Rússia, e priorização da unidade do Margem de Rio Verde quase que exclusivamente para exportação, valendo-se da ausência de restrições comerciais para exportação de carne bovina em Goiás. As exportações de carnes suínas e de frango também caíram no período (2005-2006).
 
Apesar da queda da balança comercial no Município, fruto de problemas externos, como o baixo preço internacional de commodities como a soja, a falta de uma política agrícola federal para o setor agrícola, e da gripe aviária, Rio Verde foi em 2006, o 6º maior exportador de Goiás e o 198º Município que mais exportou no País.
 
Em 2007, com o início das primeiras exportações amparadas pelo Escritório Municipal de Exportação, lotado na Secretaria de Indústria e Comércio da Prefeitura Municipal de Rio Verde, espera-se uma melhora na balança comercial. Apesar de se tratar de exportações de micro e pequenos empresários, ou seja, de volumes relativamente pequenos comparados aos das commodities, espera-se um ganho maior com o aumento do valor agregado dos produtos e com a diversificação da balança comercial.